改底要根據養殖階段不同，分為放苗前、養殖前期、養殖中期、養殖后期。進入秋冬季，將魚出售以后，將池塘中的水排干，讓塘底曬至龜裂、發白，以龜裂縫隙至少插入一根手指為宜。曬塘后用推土機拖走上層淤泥，或者在排水時放掉一部分泥。
干法清塘：干法清塘是選擇晴天，池底4-6厘米水，選質量好的成塊生石灰，每畝70kg，放入塘底預先挖成的若干淺潭中和水溶化后，趁熱向四周和岸邊潑灑，保證全池均灑到，然后用泥耙把生石灰和淤泥來回攪拌，加強清塘除雜作用。帶水清塘：放好水后，一畝用生石灰150kg，溶化后迅速潑灑全池，兩種方法都需5-7天藥性能消失。另外還可以選用漂白粉、茶麩等。2、養殖中后期的底質改良措施
- 勤增氧：增氧是底質改良重要的環節，特別是底部增氧能有效分解沉積的殘餌糞便等有害物質，激活底泥生態功能。底部增氧可采用微孔增氧方式，增氧效果較好。
葉輪式增氧機，能打破氧分層、產生提水和混合水體的作用，有利于提高底部溶氧，加快有機物分解。
- 攪底：每隔8-10天，選擇晴天的上午用鐵鏈或者特制的攪底工具進行拉底，將底部沉積的有機物攪動起來，利于其氧化分解，同時釋放其中營養鹽，供浮游植物使用。但是拉底要分區進行，不能一次性將整個池塘拉完，防止有機物懸浮，大量耗氧，造成缺氧現象。
- 噴排：使用深水泵將底部泥水混合物抽提，向空中噴灑。增加污泥與空氣的接觸，加速有機物的氧化分解。（2）化學方法：
- 氧化分解型顆粒底改劑：這類底改劑能夠氧化分解底部的有機物，提高池底的氧化還原電位，增加池底的緩沖性，祛除氨氮、亞硝酸鹽等有毒氣體，尤其是硫化氫。當底質長期處于不良狀態，環境中的有害菌數量較多，此時直接用微生物效果不大，要先用此類底改劑尤其是顆粒型，把底部水體的有害物質降到一定濃度，再使用生物制劑。
- 吸附性粉劑底改：這類改底劑包括了沸石粉、麥飯石粉等，能夠吸附有毒有害物質沉到底部，起到對水體的凈化作用，但由于有毒有害物質仍然存在，并沒有消除，因而這類產品治標不治本。在實際使用時搭配氧化分解型的顆粒底改產品或者微生態產品可從根本上消除這些物質。（3）生物方法：
使用乳酸菌、芽孢桿菌等微生態制劑，改善水中及底質中的微生物優勢群落，抑制有害微生物的生長繁殖，同時分解有機物，以達到改良底質和水質的目的。
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