在水產養殖中，有機酸出現的頻率是很高的。有機酸是指廣泛存在于生物中的一種含有羧基的酸性有機化合物(不包括氨基酸)。大多數時候我們都把有機酸當做一款解毒產品在使用，忽略了它在水產養殖中帶來的其他價值。要正確認識和發揮有機酸的作用，就需要我們深入了解其作用機理。
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有機酸的作用機理-抑菌作用
有機酸可通過解離出的酸根離子或者氫離子進入細菌細胞膜內使胞內滲透壓增加，內環境的酸值降低，導致細菌正常代謝紊亂，甚至裂解死亡，間接降低有害細菌的數量。
有機酸不僅可以降低環境中的 pH 值，還可以通過破壞細菌細胞膜、干擾細菌酶的合成、影響細菌 DNA 的復制等達到抑菌的目的。
在有機酸中殺菌抑菌效果最強的就是甲酸類。甲酸鈣、二甲酸鉀等作為經過處理的有機酸制劑，相比于液體有機酸的刺激性，它們在使用時性能更穩定。
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提高攝食、提高消化率和增重率
有機酸可促進水產動物對食物的吸收、提升蛋白質的利用率，進而提高水產品的產值與品質，在魚類蝦類河璧等中大量使用。
甲酸鈣作為有機酸化劑通過提高飼料的酸度，使胃蛋白酶、胰蛋白酶等的活性增強，代謝活動變強,增加水產動物對飼料的消化效率促進生長。
甲酸鈣在具備殺菌護腸促消化的作用外，還能提供30.1%的小分子有機鈣源，補充水產動物生長所需的鈣質。
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加強消化和抗應激作用
有機酸通過影響代謝活動,提高酶活性來促進水產動物的消化。有機酸能夠減少氨的合成和控制生成有害的代謝產物，還能阻礙免疫介導因子的合成和分泌，提升機體抵抗力。有機酸通過促進水產動物腸道內有益菌 (如雙歧桿菌)的繁殖,控制有害菌繁殖,使腸道菌群結構向好的方面改變,促進維生素鈣等的吸收,提高水產動物的抗病能力和抵抗力。
有機酸能夠參與三羧酸循環和ATP的生成與轉化, 加快水產動物的代謝；還參與氨基酸的轉換, 在應激原的刺激下, 機體可合成ATP, 產生抗應激作用。
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緩解金屬毒性，降低養殖環境的污染
有機酸以水體潑灑的方式進入養殖環境中，通過吸附、氧化或者絡合Pb 、Cd 、Cu 、Zn等重金屬，減緩重金屬的毒性。乙酸有利于重金屬 Cd2+ 向交換態轉變，在一定范圍內質量摩爾濃度增加，解毒效果越好。此外，有機酸還可使養殖廢水中的分子氨轉化為 NH4+，然后結合氨離子生成穩定的銨鹽，降低水中有毒氨的毒性。
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有助于培藻，增強池塘自凈能力
在高pH塘口使用有機酸除了降低pH以外，同時可以為藻類提供碳源，使有益藻類更容易生長，控制有害藻類。
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降低水體pH和穩定水質
在放苗前及養殖過程中使用，能迅速降低高的pH值，并穩定池水的pH值，穩定水質。
